科學(xué)家們想要知道體細(xì)胞(非遺傳性)突變是否在衰老和大腦變性(brain degeneration)中發(fā)揮著作用,但是直到*近還沒(méi)有好的技術(shù)來(lái)測(cè)試這種想法。在一項(xiàng)新的研究中,來(lái)自美國(guó)波士頓兒童醫(yī)院和哈佛醫(yī)學(xué)院的研究人員對(duì)單個(gè)神經(jīng)元進(jìn)行全基因組測(cè)序,發(fā)現(xiàn)隨著我們的年齡增加大腦中的突變逐漸積累的有力證據(jù)。他們也發(fā)現(xiàn)在患上遺傳性早老性**(導(dǎo)致早期大腦變性)的人中,突變積累的速度更快。相關(guān)研究結(jié)果于2017年12月7日在線發(fā)表在Science期刊上,論文標(biāo)題為“Aging and neurodegeneration are associated with increased mutations in single human neurons”。論文**作者為Michael A. Lodato、Rachel E. Rodin、Craig L. Bohrson、Michael E. Coulter、Alison R. Barton和Minseok Kwon。
論文共同通信作者、波士頓兒童醫(yī)院遺傳學(xué)與基因組學(xué)系主任Christopher A. Walsh博士說(shuō),“針對(duì)DNA突變是否能夠在神經(jīng)元(通常不會(huì)分裂)中積累,以及隨著我們變老,它們是否導(dǎo)致大腦經(jīng)歷的功能喪失,這是一個(gè)存在已久的問(wèn)題。在此之前解答這個(gè)問(wèn)題是不可能的,這是因?yàn)槲覀儾荒軌驅(qū)蝹€(gè)細(xì)胞的基因組進(jìn)行測(cè)序,而且積累的每個(gè)突變對(duì)每個(gè)細(xì)胞都是獨(dú)特的?!?
逐個(gè)地測(cè)試神經(jīng)元
這些研究人員對(duì)從美國(guó)國(guó)家衛(wèi)生研究院神經(jīng)生物庫(kù)(NIH NeuroBioBank)的尸檢樣本中獲得的162個(gè)神經(jīng)元的DNA進(jìn)行了測(cè)試。它們來(lái)自15名不同年齡(4個(gè)月大至82歲)的神經(jīng)系統(tǒng)正常的人,9名患有兩種加速衰老的早發(fā)性神經(jīng)退行性**---科凱恩綜合征(Cockayne syndrome)和著色性干皮癥(xeroderma pigmentosum)---之一的人。
通過(guò)使用*新的實(shí)驗(yàn)技術(shù)和數(shù)據(jù)分析技術(shù),這些研究人員能夠檢測(cè)每個(gè)神經(jīng)元遺傳密碼中的小到單個(gè)堿基的變化。每個(gè)細(xì)胞通過(guò)產(chǎn)生大量的DNA拷貝來(lái)擴(kuò)增它的基因組,隨后人們才能確定它的DNA序列,而且必須分析大量的數(shù)據(jù)。
論文共同通信作者、哈佛醫(yī)學(xué)院生物醫(yī)學(xué)信息學(xué)系研究員Peter J. Park博士說(shuō),“鑒于在單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)中出現(xiàn)很多實(shí)驗(yàn)性假象,一種能夠區(qū)分真實(shí)突變和實(shí)驗(yàn)噪聲的新型計(jì)算方法對(duì)這個(gè)研究項(xiàng)目的成功至關(guān)重要?!?
這些接受測(cè)試的神經(jīng)元來(lái)自與年齡相關(guān)性認(rèn)知衰退有關(guān)的兩個(gè)大腦區(qū)域:前額葉皮層(人類大腦中*為高度發(fā)育的一部分)和海馬體齒狀回(阿爾茨海默病等年齡相關(guān)退行性**中的病灶位點(diǎn))。
在來(lái)自神經(jīng)系統(tǒng)正常的人的神經(jīng)元中,這兩個(gè)大腦區(qū)域中的基因突變數(shù)量隨著年齡的增加而增加。不過(guò),在齒狀回中的突變以更高的速度進(jìn)行積累。這些研究人員認(rèn)為這可能是因?yàn)檫@些神經(jīng)元具有分裂的能力,不同于前額葉皮層中不能分裂的神經(jīng)元。
在來(lái)自科凱恩綜合征和著色性干皮癥患者的神經(jīng)元中,前額葉皮層中的突變隨著時(shí)間的推移而增加---比正常速率高出兩倍以上。此外,在來(lái)自無(wú)錫藥明康德NextCODE公司的合作者的幫助下,這些研究人員發(fā)現(xiàn)了這些神經(jīng)元以*高的速度積累著*多突變的基因組區(qū)域。
衰老的基因組
這些研究人員創(chuàng)造了術(shù)語(yǔ)genosenium---將基因組(genome)和衰老/老年(senescence/senility)的概念結(jié)合起來(lái)---來(lái)表達(dá)突變逐漸地不同避免地積累導(dǎo)致大腦衰老的想法。
這些突變本身分為三類。Lodato說(shuō),“我們能夠獲得我們發(fā)現(xiàn)的所有突變,并利用數(shù)學(xué)技術(shù)將它們劃分為不同類型的DNA變化?!?
一類“時(shí)鐘般準(zhǔn)確的”突變嚴(yán)格地與衰老相關(guān),像時(shí)鐘發(fā)條那樣在這兩個(gè)大腦區(qū)域中積累著,與**狀態(tài)無(wú)關(guān)。另一種突變類型與年齡無(wú)關(guān),除了在齒狀回中,分裂神經(jīng)元(dividing neuron)中的突變數(shù)量確實(shí)隨著時(shí)間的推移而增加。
與癌癥相伴隨嗎?
第三種類型的突變與DNA氧化性損傷和DNA修復(fù)缺陷相關(guān);它們隨著年齡的增加而增加,而且在科凱恩綜合征和著色性干皮癥患者的神經(jīng)元中較高數(shù)量地存在著,但是在正常的神經(jīng)元中存在的數(shù)量要少得多。
Walsh俏皮地說(shuō)道,“這個(gè)*后的發(fā)現(xiàn)讓我確信我需要更多的抗氧化劑??傮w而言,它提出一個(gè)問(wèn)題:神經(jīng)退行性**是否像癌癥那樣,*終與DNA突變相關(guān)聯(lián)?!?
這些研究人員如今將他們的目光轉(zhuǎn)向其他的神經(jīng)退行性**。Walsh說(shuō),“我們使用的技術(shù)能夠應(yīng)用于任何一種大腦退行性**?!?