1. 估算組織細(xì)胞的用量。每次微量提取一般需要100-200 mg植物葉片、或50-100 mg植物種子、或200-500 mg植物果實(shí)。
2. 樣品破碎:
1) 勻漿法:先將新鮮植物組織剪切成小塊(保存在RNALOCKER中的植物組織需用紙吸去RNALOCKER液體后再剪切成小塊),放入10-15 mL塑料離心管中,加入1 mL溶液A,然后用勻漿器勻漿5-20秒。勻漿時(shí)會(huì)產(chǎn)生泡沫,但不影響提取效果。
2) 液氮研磨法(適用于復(fù)雜,易降解樣品):取適量新鮮植物組織放入含液氮的研缽中,迅速將組織研磨成粉末后,將粉末轉(zhuǎn)移到合適的塑料離心管中,加入1 mL溶液A,立即劇烈振蕩20秒,充分混勻。
注意:溶解溶液A沉淀。如果把溶液A放在4℃放置,一段時(shí)間后可能會(huì)產(chǎn)生沉淀,此種情況下使用前必須放在65℃水浴使沉淀徹底溶解并充分搖勻后再取用。
3. 將勻漿物或研磨物轉(zhuǎn)移至干凈的1.5 mL塑料離心管中(可以不必轉(zhuǎn)移非液體的細(xì)胞碎片)。有的植物組織(比如果實(shí))含有大量水份,勻漿液會(huì)多于1 mL,轉(zhuǎn)移時(shí)也只取1 mL。
4. 在離心管中加入0.3 mL的溶液B和0.2 mL自備氯仿,在振蕩器上振蕩30秒混勻,此時(shí)溶液呈均勻的乳濁狀。振蕩器振蕩時(shí)必須使管底溶液震蕩起來。
5. 室溫12000 rpm離心3-5分鐘,兩相間將有約5毫米厚的細(xì)胞破碎物。
6. 將上清液(約0.6 mL)轉(zhuǎn)移到另一干凈的1.5 mL塑料離心管中,下層有機(jī)相和中間層含有DNA、蛋白質(zhì)和其他雜質(zhì),避免觸及或吸取。*好留下100 uL上清液不取。
7. 加入跟上清液等體積的溶液C,充分顛倒混勻。如果有沉淀產(chǎn)生(對(duì)某些植物,屬于正?,F(xiàn)象),千萬不要去掉沉淀,一定要把所有的混合物上柱。
8. 將一半的混合液(含沉淀物,如果有的話)轉(zhuǎn)移到離心吸附柱中,12000 rpm室溫離心半分鐘,棄穿透液。
9. 將剩下的一半的混合液(含沉淀物,如果有的話)轉(zhuǎn)移到同一離心吸附柱中,12000 rpm室溫離心半分鐘,棄穿透液。
10. 加0.7 mL通用洗柱液,12000 rpm室溫離心半分鐘,棄穿透液。再加0.3 mL通用洗柱液,12000 rpm室溫離心半分鐘,棄穿透液。一般樣品如此洗滌兩次即可,但對(duì)于在第7步加入溶液C后有沉淀產(chǎn)生的樣品,則需要洗三次,每次加入的通用洗滌液的量分別為0.4、0.3和0.3 mL,其他操作不變。
11. 12000 rpm室溫離心10秒以便去除殘留液體。此步很重要,否則殘留的通用洗柱液會(huì)抑制后續(xù)反應(yīng)中DNase的活性。
12. 將10 uL(10 U)的RNase-free DNase加入到50 uL 37℃預(yù)熱的DNA膜反應(yīng)液中,吹打混勻配制成DNase工作液。
13. 將DNase工作液在37℃預(yù)熱1分鐘,然后全部加入到離心吸附柱中,室溫放置5分鐘。注意:5分鐘一般足夠降解大多數(shù)情況下的DNA污染。如果DNA沒有徹底降解(可能由于樣品中殘留的雜質(zhì)抑制了DNase的活性),此步的保溫時(shí)間可以適當(dāng)延長(zhǎng)到10分鐘或15分鐘。
14. 直接在離心吸附柱中加0.7 mL通用洗柱液,蓋上蓋后顛倒數(shù)次混勻。
15. 12000 rpm室溫離心半分鐘,棄穿透液。
16. 再加0.3 mL通用洗柱液到離心吸附柱中,12000 rpm室溫離心半分鐘,棄穿透液。
17. 12000 rpm室溫離心半分鐘。此步十分重要,否則殘留的乙醇(通用洗柱液中的成分)會(huì)影響RNA的使用。
18. 將離心吸附柱轉(zhuǎn)移到RNase-free收集管中,加入30-50 uL RNA洗脫液,室溫放置1-2分鐘。
19. 12000 rpm室溫離心半分鐘,離心管中溶液即為RNA樣品。本產(chǎn)品提供的離心吸附柱吸附力較強(qiáng),一次洗脫不能全部將膜上RNA洗下,如有必要,可以再加入30-50 uL RNA洗脫液一次。
20. 所得RNA溶液可以立即使用或存放于-80℃待用。如果要進(jìn)行甲醛變性電泳檢測(cè)。如果使用非變性膠電泳,則必須使用RNAon上樣液。千萬不能使用DNA上樣液(因?yàn)樗话銢]經(jīng)過去RNase處理)。
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